Struktur kurikulum Program Studi Magister Teknik Mesin terdiri dari 4 (empat) komponen dengan total 56 (lima puluh enam) sks. Ketiga komponen tersebut adalah (1) Mata Kuliah Wajib Umum Institusional Pascasarjana Unesa sebanyak 13 (tiga belas) sks (2) Matakuliah Bidang Studi Wajib Prodi , sebanyak 21 (dua puluh satu) sks (3) Matakuliah Bidang Studi Pilihan, sebanyak 9 (Sembilan) sks (4) Matakuliah Kelompok Tesis, sebanyak 13 (tiga belas) sks yang terdiri dari Proposal Penelitian, Publikasi, Seminar Hasil, dan Tesis.